34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0177 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  43.62 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  45.52 
 
 		 217 aa  97.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  37.78 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  37.04 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  43.38 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  30.26 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  29.8 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  34.16 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  38.61 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  30.19 
 
 		 287 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  29.09 
 
 		 272 aa  51.2  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  28.14 
 
 		 265 aa  51.2  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  33.89 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  28.35 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  29.7 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  33.15 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  31.94 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  33.15 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  29.35 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  29.79 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  30.96 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  28 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  31.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  34.23 
 
 		 263 aa  44.7  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  31.2 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  31.11 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  38.55 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  30.35 
 
 		 262 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  27.64 
 
 		 261 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  30.34 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>