30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2348 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  74.26 
 
 		 202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  74.26 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  56.77 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  43.38 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  43.15 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  33.17 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30.86 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  36.32 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  31.97 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  29.34 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  36.75 
 
 		 253 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  36.44 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  31.61 
 
 		 259 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  35.14 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  31.53 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  30.63 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  30.63 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  31.68 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  35.04 
 
 		 253 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  37.61 
 
 		 327 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  33.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  32.05 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  29.34 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  32.05 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  37.14 
 
 		 276 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>