21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0424 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  99.01 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  74.26 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  49.46 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  37.04 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  36.73 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  31.06 
 
 		 249 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  32.56 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  32.56 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  31.35 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  26.97 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  31.28 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  29.7 
 
 		 252 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  37.35 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  29.46 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  32.11 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  27.63 
 
 		 259 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  32.98 
 
 		 253 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  32.35 
 
 		 263 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>