82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5157 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  71.49 
 
 
252 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  71.73 
 
 
250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  62.71 
 
 
253 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  62.71 
 
 
253 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  69.1 
 
 
247 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  66.38 
 
 
254 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  62.14 
 
 
251 aa  278  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  60.17 
 
 
257 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  52.79 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  50.86 
 
 
249 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  50.46 
 
 
253 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  50.46 
 
 
253 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  48.23 
 
 
260 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  41.1 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  71.11 
 
 
122 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  37.66 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  37.66 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  31.17 
 
 
244 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  33.05 
 
 
275 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  32.74 
 
 
253 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  36.24 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  33.19 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  34.03 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  32.63 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  34.5 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  33.47 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  35.1 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  32.32 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  32.97 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  33.21 
 
 
278 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  34.8 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  31.11 
 
 
327 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  32.57 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  30.12 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  32.19 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  32.35 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  29.57 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  41.03 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  31.9 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  31.18 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  29.85 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  34.29 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.63 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  33.1 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  36.15 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  35.86 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.46 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  30.97 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  31.94 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  29.79 
 
 
195 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  30.91 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  31.17 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  26.88 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  27.69 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  30.05 
 
 
206 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  31.82 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  30.05 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  33.8 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  28.65 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  33.11 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  29.21 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  28.93 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  30.3 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  28.93 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  30.25 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  34.57 
 
 
168 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  38.75 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  32.88 
 
 
182 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2250  hypothetical protein  38.75 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  26.87 
 
 
264 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>