45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1073 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  621  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  34.5 
 
 		 270 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  35.51 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  34.16 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  33.21 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  37 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  33.45 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  35.85 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30.65 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  35.66 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.54 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  38.57 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  33.67 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  36.87 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  42.14 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  29.58 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  45.74 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  28.06 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  31.4 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  33.57 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  28.8 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  34.88 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  36.05 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  30.51 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  33.73 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  28.33 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  32.13 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  28.33 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  30.43 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  33.76 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  30.42 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  32.21 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  37.24 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  26.89 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  31.8 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  31.8 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  32.98 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.16 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  37 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  30.05 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.79 
 
 		 230 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  29.63 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>