83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3382 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  61.63 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  52.34 
 
 		 253 aa  261  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  45.04 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  32.35 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  32.14 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  34.27 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  31.17 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  34.27 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  30.93 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  35.37 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  31.36 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  35 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  31.46 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  31.08 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  28.81 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  31.82 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  30.52 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  30.96 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  30.84 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  30.65 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  32.2 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  31.98 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  31.19 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  29.94 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  33.94 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  30.5 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  30.36 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  27.88 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  26.73 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  32.12 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  25.78 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  31.21 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  28.76 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  29.32 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  28.04 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  26.64 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  29.53 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  29.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  27.43 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  30.32 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  29.8 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  29.41 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  24.86 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  26.9 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  27.33 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  26.96 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  28.47 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  32.84 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  27.71 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  32.17 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  25.95 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  28.3 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  28.3 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  26.24 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  30.91 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  28.27 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  22.37 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  30.65 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  27.08 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  38.46 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  24.86 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  23.91 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  27.36 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  24.08 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  23.83 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  21.35 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  31.48 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  32.11 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  24.02 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  26.21 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  26.36 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  23.93 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  25.23 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  25.74 
 
 		 170 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  23.56 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  23.03 
 
 		 290 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  28.68 
 
 		 273 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  20.42 
 
 		 237 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  29.03 
 
 		 207 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  24.29 
 
 		 207 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  29.84 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>