82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2343 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  50.65 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  45.04 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  48.64 
 
 		 244 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  37.66 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  33.01 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  34.62 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  34.89 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  33 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  33 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  33.18 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  34.72 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  33.18 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  33 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  31.37 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  30.3 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.62 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  32.14 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  31.45 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  33.89 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  38.69 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  28.3 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  29.22 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  31.72 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  27.91 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  28.75 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  35.71 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  30.19 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  30.16 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  30.33 
 
 		 314 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  29.95 
 
 		 314 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  31.9 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  30.16 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  30.43 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  36.7 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  30.48 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  29.15 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  30.19 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  32.06 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  38.61 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  32.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  28.16 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  30.63 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  30.63 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  31.96 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  33.78 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  34.29 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  32.67 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  25.16 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  29.66 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  28.1 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  42.19 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  37.35 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  32.93 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  34.29 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  36.09 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  28.28 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  34.15 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  37.88 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  26.56 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  30.38 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  26.81 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  30.61 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  33.01 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  26.97 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>