75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2800 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  66.38 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  69.14 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  71.55 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  65.97 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  64.1 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  64.71 
 
 		 253 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  62.18 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  62.39 
 
 		 250 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  52.12 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  49.38 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  49.38 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  51.34 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  51.46 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  48.02 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  43.53 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  38.2 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  35.78 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  35.74 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  59.34 
 
 		 122 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  33.64 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  31.7 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  36.04 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  35.24 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  36.02 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  35.68 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  39.59 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  35.09 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  34.21 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  36.21 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  34.41 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  34.55 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  34.2 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  30.89 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  33.92 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  36.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  34.73 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  37.58 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  34.39 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  33.18 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.86 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  33.55 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  31.08 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  31 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  29.65 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  30.26 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  30.66 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  29.15 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  29.86 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  29.93 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  28.44 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  29.74 
 
 		 318 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  39.44 
 
 		 170 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  39.44 
 
 		 170 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1610  hypothetical protein  41.46 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  39.44 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  27.92 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  35.21 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  32.84 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2250  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  38.81 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  27.86 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  30.32 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  39.53 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  35.21 
 
 		 170 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>