More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1610 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1610  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  413  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  93.45 
 
 
228 aa  298  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2250  hypothetical protein  93.01 
 
 
228 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2202  hypothetical protein  66.2 
 
 
246 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0843846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4045  RecA/RadA recombinase-like  38.62 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  35.75 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  32.73 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  34.62 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  27.06 
 
 
343 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  35.16 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  37.13 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  38.46 
 
 
346 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  36.92 
 
 
355 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  36.15 
 
 
347 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  31.76 
 
 
352 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  32.68 
 
 
362 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  30.94 
 
 
361 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  36.15 
 
 
349 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  37.01 
 
 
346 aa  62.8  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  35.38 
 
 
341 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  35.66 
 
 
344 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  34.09 
 
 
387 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  29.53 
 
 
379 aa  62.8  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  29.74 
 
 
379 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  36.92 
 
 
345 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  34.88 
 
 
361 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  29.12 
 
 
357 aa  62.4  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  27.72 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  27.72 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  35.38 
 
 
346 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  39.89 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  34.97 
 
 
348 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  36.36 
 
 
348 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  27.12 
 
 
349 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  34.38 
 
 
414 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  27.23 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  28.35 
 
 
343 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  29.51 
 
 
356 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  34.46 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  35.94 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  29.28 
 
 
368 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  35.82 
 
 
352 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  35.88 
 
 
352 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  27.23 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  27.84 
 
 
343 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  28.15 
 
 
377 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  27.84 
 
 
343 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  36.87 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  34.09 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  33.12 
 
 
347 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  27.84 
 
 
343 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  37.97 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  35.16 
 
 
729 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  34.09 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  33.71 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  27.84 
 
 
343 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  33.09 
 
 
379 aa  59.7  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  37.69 
 
 
350 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  25.93 
 
 
349 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  35.16 
 
 
365 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  32.81 
 
 
385 aa  59.7  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  33.33 
 
 
349 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  35.16 
 
 
358 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  33.59 
 
 
428 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2973  recA protein  26.87 
 
 
375 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.480691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  30.94 
 
 
418 aa  59.3  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1120  recA protein  37.93 
 
 
348 aa  58.9  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  35.38 
 
 
345 aa  58.9  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  34.38 
 
 
361 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  37.23 
 
 
183 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  32.28 
 
 
347 aa  58.5  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  35.16 
 
 
350 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  34.38 
 
 
367 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  32.03 
 
 
347 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  35.16 
 
 
364 aa  58.5  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  26.69 
 
 
349 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  35.16 
 
 
348 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  29.13 
 
 
344 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  35.16 
 
 
345 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  28.44 
 
 
357 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  35.16 
 
 
347 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  33.59 
 
 
351 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  35.94 
 
 
357 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.51 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  32.87 
 
 
346 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  31.71 
 
 
365 aa  57  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2081  RecA domain protein  33.33 
 
 
132 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  32.56 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  33.59 
 
 
347 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  35.38 
 
 
376 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  33.96 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  34.04 
 
 
344 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  36.43 
 
 
348 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  31.21 
 
 
327 aa  56.6  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  33.96 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  31.21 
 
 
359 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  31.33 
 
 
356 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>