195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1327 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  31.98 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  33.91 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  33.9 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  32.63 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  34.57 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  33.77 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  27.91 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30.05 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  33.77 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  29.63 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  32.28 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  31.21 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  31.36 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  30.57 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  30.05 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  34.84 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  28.5 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  29.48 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  31.69 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  31.85 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  28.14 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.55 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  28.97 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  30.53 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  30.81 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  27.83 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  28.5 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  28.5 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  31.85 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  28.8 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  30.9 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  30.11 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  28 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  28.81 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  27.17 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  29.94 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  27.69 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  32.28 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  30.98 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  31.18 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  31.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  31.18 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  31.11 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  25.57 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  30.05 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  26.06 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  37.21 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  32 
 
 		 920 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  31.45 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  44.71 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  33.65 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  30.83 
 
 		 346 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  31.58 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  29.57 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  30.63 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  31.58 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  33.65 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  32.08 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  37.21 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  36.04 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  30.05 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  24.81 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  31.78 
 
 		 344 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  28.27 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  26.06 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  33.88 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  31.86 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  32.71 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  31.13 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  27.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  31.73 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  30.39 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  30.19 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0841  recombinase A  30.19 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  unclonable  0.0000000182986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  30.19 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  30.19 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  30.19 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  30.19 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  30.19 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  30.19 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  30.19 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  30.19 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  30.19 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>