65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2527 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  40.5 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  33.91 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  32.35 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  40.69 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  32.94 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  38.84 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  38.84 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  36.55 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  38.12 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  36.41 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  38.33 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  33.04 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  36.4 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  36.61 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  35.87 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  35.92 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  36.36 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  37.56 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  34.76 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  38.21 
 
 		 327 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  35.13 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  36.32 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  36.59 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  37.73 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  34.45 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  32.81 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  36.49 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.32 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  31.28 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  32.08 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  34.3 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  33.63 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  31.76 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  45.16 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  36.89 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  30.89 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  31.13 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  37.97 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  34.38 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  33.5 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  28.14 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  30.26 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  30.92 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  31.74 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  34.21 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  34.59 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  34.59 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  31.76 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  33.09 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  32.32 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  31.75 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  30.67 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  30.67 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  26.63 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  29.86 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2202  hypothetical protein  36.22 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0843846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>