111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1225 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  56.44 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  51.21 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  46.72 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  48.68 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  49.05 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  48.57 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  43.93 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  43.26 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  41.78 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  39.32 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  44.02 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  42.65 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  52.55 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  42.79 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  43.66 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  45.41 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  47 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  44.02 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  42.72 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  42.72 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  42.72 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  45.83 
 
 		 294 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  39.44 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  44.83 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  42.72 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  42.25 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  44.62 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  48.66 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  47.42 
 
 		 342 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  44.13 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  45.79 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  43.85 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  44.02 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  39.51 
 
 		 279 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.23 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  40.49 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  42.11 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  43.85 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  41.4 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  39.6 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  42.47 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  45.68 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  44.64 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  47.95 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  45.7 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  45.7 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  45.7 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  45.7 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  45.7 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  45.7 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  41.59 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  47.95 
 
 		 206 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  43.62 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  47.95 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  44.39 
 
 		 920 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  45.95 
 
 		 206 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  33.76 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  32.66 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  43.21 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  44.28 
 
 		 309 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  35 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  38.51 
 
 		 214 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  38.51 
 
 		 214 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  34.5 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  34.01 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  38.66 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  32.26 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  31.69 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  41.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  35.63 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  27.53 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  27.81 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  34.29 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  35.62 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  32.32 
 
 		 170 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  35.62 
 
 		 168 aa  52  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  31.53 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  31.87 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  32.17 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  29.79 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  33.59 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  29.29 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  32.88 
 
 		 170 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  32.14 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  31.88 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  29.89 
 
 		 168 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  34.25 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  35.16 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>