63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4947 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  58.02 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  58.02 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  57.67 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  52.79 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  55.33 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  52.3 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  51.88 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  52.65 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  47.64 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  51.87 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  50.85 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  48.93 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  52.61 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  48.92 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  39.53 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  40.68 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  36.15 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  36.55 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  30.4 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  36.77 
 
 		 259 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  34.8 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  35.55 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  47.83 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  33.68 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  34.3 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.63 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  33.62 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  35.1 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  35.25 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  27.82 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.7 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  35.68 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  30.83 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  33.72 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  34.55 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  27.17 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  32.82 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  32.38 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  31.93 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  28.15 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  29.56 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  31.61 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  33.58 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  32.64 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  26.49 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  29.2 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  32.08 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  27.21 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  31.87 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  25.32 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  26.46 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1610  hypothetical protein  38.64 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  33.6 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2250  hypothetical protein  37.65 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  37.65 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  29.78 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  34.48 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>