105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3516 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  65.48 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  65.29 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  64.71 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  64.71 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  64.71 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  64.71 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  71.33 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  69.39 
 
 		 170 aa  204  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  69.39 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  69.59 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  68.92 
 
 		 170 aa  201  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  58.82 
 
 		 170 aa  200  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  60.36 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  62.5 
 
 		 170 aa  197  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  60.69 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  46.43 
 
 		 290 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.53 
 
 		 278 aa  84.3  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.44 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.44 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  34.69 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  35.25 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  33.65 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  31.34 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  37.76 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  32.52 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  36.73 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  36.11 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  31.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  41.1 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  31.67 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  29.85 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  36.73 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  31.3 
 
 		 216 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  30.77 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  30.77 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  30.77 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  24 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  36.47 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  28.7 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  30.48 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  26.92 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  29.91 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  31 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  31.25 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  27.35 
 
 		 235 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  28.21 
 
 		 260 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  34.78 
 
 		 240 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  31.07 
 
 		 235 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  31.07 
 
 		 235 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  30.43 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  29.46 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  35.62 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  28.57 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  30.48 
 
 		 244 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  26.56 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  28.24 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  30.95 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  34.02 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  30.53 
 
 		 920 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  30.36 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  28.41 
 
 		 280 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  28.89 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  26.77 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  26.77 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  26.77 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  25.49 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  29.87 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  31.08 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  26.61 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  33.8 
 
 		 253 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  27.66 
 
 		 252 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  26.17 
 
 		 273 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  27.96 
 
 		 255 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  35.21 
 
 		 254 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  27.96 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  32.39 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  31.51 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  29.47 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  26.21 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  28.89 
 
 		 158 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  29.58 
 
 		 251 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  28.89 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  28.57 
 
 		 230 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>