90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2400 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  61.63 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  55.56 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  48.64 
 
 		 245 aa  234  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  39.53 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  37.66 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  33.91 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  34.55 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  34.55 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  37.27 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  36.94 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  38.14 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  36.87 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  36.28 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  32.75 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  35.32 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  35.32 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  32.87 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  33.8 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  31.96 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  31.88 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  32.31 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  36.08 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  32.41 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  28.29 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  33.92 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  26.89 
 
 		 314 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  30.05 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  27.16 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  30.2 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  29.06 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  33.95 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  32.12 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  28.19 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  28.19 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  28.25 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  31.75 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  27.88 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  29.15 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  28.64 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  30.43 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  27.21 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  24.75 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  23.3 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  32.53 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  32.53 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  35.21 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  32.56 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  30.48 
 
 		 168 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  34.33 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  24.45 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  26.63 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  32.39 
 
 		 170 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  33.8 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  33.8 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  28.95 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  33.8 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  33.8 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  32.39 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  28.95 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  32.39 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  27.12 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  37.1 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  35.82 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  29.55 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  28.67 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  32.39 
 
 		 170 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  24.87 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  29.37 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  31.82 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  30.56 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  28.78 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  25.95 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  29.73 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  21.94 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  30.91 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  23.08 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  26.16 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  24.68 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>