48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1829 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  36.32 
 
 
275 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  36.81 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  36.08 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  33.68 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  35.5 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  37.77 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  34.73 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  32.99 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  36.2 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  41.78 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  33.58 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  34.62 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  32 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  32 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  32.79 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  30.73 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  32.12 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  31.98 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  36.32 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  30.49 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  36.65 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  33.14 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  31.46 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  31.11 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.28 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  30.95 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  33.15 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  30.17 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  33.74 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  28.31 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  29.12 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  26.8 
 
 
318 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  27.71 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  39.19 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  29.07 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  35.42 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  30.98 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  28.21 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  29.57 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  36.11 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  30.34 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  34.23 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  32.09 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  36.56 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.24 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  31.2 
 
 
202 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>