40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3892 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  91.72 
 
 
314 aa  497  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  46.88 
 
 
318 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  41.72 
 
 
327 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  31.94 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  31.25 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  29.06 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  26.24 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  30.13 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  28.52 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  31.36 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  27.8 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  28.37 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  28.64 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  29.05 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  31.93 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  37.04 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  29.06 
 
 
261 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  32.69 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  35.44 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  29.06 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  30.95 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  30.73 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  30.73 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  29.95 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  28.84 
 
 
261 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  33.64 
 
 
249 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  34.38 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  31.6 
 
 
268 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  30.4 
 
 
259 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  27.31 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  38.61 
 
 
228 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  32.12 
 
 
214 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  32.12 
 
 
214 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  31.28 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  31.43 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  32.35 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  28.19 
 
 
247 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>