52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4574 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  86.43 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  61.28 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  57.62 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  59.05 
 
 		 249 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  53.69 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  49.38 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  50.46 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  51.16 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  45.91 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  45.34 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  44.75 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  48.02 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  46.96 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  34.55 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  38.84 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  37.44 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  34.27 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  38.74 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  39.04 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  33 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  41.4 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  34.67 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  36.65 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  38.64 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  34.68 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  37.18 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  33.07 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  38.63 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  33.2 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  37.14 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  40.79 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  31.1 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  44.21 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  34.31 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  34.33 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  31.18 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  30.09 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  31.5 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  30.28 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.47 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  34.12 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  32.56 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.18 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  32.16 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  26.74 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  32.19 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>