59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0810 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  96.84 
 
 
253 aa  474  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  70.04 
 
 
251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  62.71 
 
 
253 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  64.68 
 
 
257 aa  291  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  66.12 
 
 
247 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  58.66 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  65.97 
 
 
254 aa  278  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  60 
 
 
250 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  52.12 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  52.23 
 
 
249 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  52.87 
 
 
249 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  45.91 
 
 
253 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  45.91 
 
 
253 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  48.71 
 
 
260 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  40.69 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  40.33 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  35.32 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  34.62 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  30.93 
 
 
244 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  39.13 
 
 
259 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  53.26 
 
 
122 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  37.6 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  41.06 
 
 
253 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  35.57 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  33.17 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  35.52 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  36.44 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  37.34 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  30.53 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  37.16 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  34.8 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  32.37 
 
 
327 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  34.72 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  32.07 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.1 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  30.34 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  30.46 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  27.87 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  32.07 
 
 
294 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  31.68 
 
 
207 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  29.8 
 
 
255 aa  52  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  31.39 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  41.98 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  31.65 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  32.32 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  28.99 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  27.41 
 
 
251 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.88 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  32.41 
 
 
317 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  31.67 
 
 
195 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  22.7 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  33.54 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  36.67 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  29.41 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  28.03 
 
 
273 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  32.98 
 
 
202 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  30.88 
 
 
249 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>