91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2670 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  534  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  57.45 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  57.45 
 
 
255 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  52.67 
 
 
294 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  55.12 
 
 
268 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  51.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  46.08 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  40.48 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  42.56 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  40.91 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  42.49 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  44.51 
 
 
237 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  45.92 
 
 
240 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  41.67 
 
 
238 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  41.44 
 
 
228 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  35.41 
 
 
240 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  42.71 
 
 
235 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  38.1 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  38.61 
 
 
280 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  41.27 
 
 
260 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  41.8 
 
 
309 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  43.27 
 
 
342 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  42.71 
 
 
235 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  42.71 
 
 
235 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  42.71 
 
 
235 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.8 
 
 
278 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  37.56 
 
 
235 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  37.62 
 
 
279 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  41.29 
 
 
236 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  43.39 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  40.49 
 
 
235 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  43.59 
 
 
204 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  46.03 
 
 
272 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  38.34 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  36.82 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  41.62 
 
 
216 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  43.86 
 
 
205 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  40.21 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  35.26 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  42.36 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  40.38 
 
 
207 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  44.02 
 
 
205 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  42.77 
 
 
206 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  43.75 
 
 
206 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  43.75 
 
 
206 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  42.72 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  41.36 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  36.36 
 
 
238 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  44.64 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  44.08 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  44.57 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  43.2 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  39.55 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  40.89 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  42.18 
 
 
920 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  31.96 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  41.51 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  41.51 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  42.56 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  35.32 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  32.28 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  29.5 
 
 
229 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  33.53 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  37.93 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  32.97 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  32.54 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  36.3 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  33.54 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  33.54 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  28.81 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  32.84 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  35.37 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  37.93 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  37.16 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  31.97 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  30.48 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  29.84 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  33.81 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  25.99 
 
 
244 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  27.81 
 
 
234 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  34.46 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>