85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1030 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  35.9 
 
 		 255 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  35.38 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  34 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  35 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  32.85 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  31.56 
 
 		 240 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  32.39 
 
 		 260 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  35.32 
 
 		 204 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  32.75 
 
 		 223 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  31.28 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  30.93 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  28.37 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.58 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  32.55 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  34.31 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  33.01 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  28.36 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  28.36 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  29.05 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  29.8 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  32.31 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  28.72 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  31.77 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  26.6 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  31.37 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  30.92 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  30.39 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  27.67 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  27.04 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  27.64 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  29.81 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  29.47 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  28.5 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  32.85 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  31.63 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  30.05 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  28.29 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  28.52 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  26.87 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  28.99 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  28.99 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  30.88 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  28.5 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  28.02 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  28.02 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  29.53 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  32.46 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  27.08 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  27.08 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  24.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  26.09 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  32.12 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  27.69 
 
 		 170 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  29.29 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  26.88 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  27 
 
 		 170 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  26.88 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  29.76 
 
 		 920 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  25.81 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  29.23 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  24.62 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  24.47 
 
 		 170 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  25.49 
 
 		 168 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  24.43 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  29.9 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  23.66 
 
 		 170 aa  45.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  31.71 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  31.25 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  21.51 
 
 		 168 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>