82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4263 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  49.57 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  53.74 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  46.4 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  46.76 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  40.97 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  42.66 
 
 		 240 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  38.26 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  40.37 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  38.99 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  41.62 
 
 		 216 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  34.6 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  34.89 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.71 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  38.64 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  39.17 
 
 		 206 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  38.63 
 
 		 228 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  33.03 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  40.62 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  37.82 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  34.17 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  35.24 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  35.24 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  37.2 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  36.2 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  36.49 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  32.27 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  39.22 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  39.38 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  38.22 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  36.82 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  32.26 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  40.62 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  34.7 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  37.82 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  37.73 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  37.73 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  37.27 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  39.62 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  42.16 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  33.01 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  36.65 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  43.24 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  37.27 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  36.82 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  40.4 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  36.53 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  35.78 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  38.46 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  32.46 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  37.61 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  35.75 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  35.75 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  34.25 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  36.94 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  43.69 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  38.19 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  36.76 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  28.14 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  38.05 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  37.16 
 
 		 920 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  38.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  33.55 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.44 
 
 		 231 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  32.29 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  32.91 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  32.57 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  24.08 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  33.75 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  29.89 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  29.38 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  30.11 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  32.73 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  31.21 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>