59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5605 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  71.49 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  75.32 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  58.66 
 
 		 253 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  58.92 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  62.71 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  64.1 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  60.26 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  63.87 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  47.64 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  47.66 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  47.41 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  45.34 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  45.34 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  48.13 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  80.22 
 
 		 122 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  37.27 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  37.18 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  33.18 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  36.7 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  31.63 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  32.55 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  34.21 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  31.51 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  33.62 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  32.74 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  33.05 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  30.32 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  27.69 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  31.33 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.49 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  31.62 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.25 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  30.27 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  34.3 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  29.83 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  32.98 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  29.7 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  31.97 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  35.04 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  38.81 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  33.94 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  29.7 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  28.45 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  33.84 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  28.77 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  39.02 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  28.77 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2250  hypothetical protein  39.02 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  27.78 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  26.62 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  30.43 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  31.95 
 
 		 279 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1610  hypothetical protein  38.1 
 
 		 226 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>