107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2166 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  43.2 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  43.43 
 
 
206 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  42 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  43.3 
 
 
278 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  47.96 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  39.69 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  39.69 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  40.22 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  41.24 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  36.22 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  40.41 
 
 
223 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  44.75 
 
 
272 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  43.92 
 
 
228 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  41.33 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  45.78 
 
 
216 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  40.24 
 
 
183 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  38.78 
 
 
206 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  38.78 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  38.78 
 
 
206 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  36.96 
 
 
273 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  39.46 
 
 
268 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  36.6 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  34.69 
 
 
250 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  39.25 
 
 
240 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  36.08 
 
 
255 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  38.66 
 
 
249 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  34.18 
 
 
240 aa  87.8  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  37.7 
 
 
235 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  32.8 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  37.84 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  36.41 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  41.36 
 
 
286 aa  85.9  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  35.87 
 
 
238 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  37.43 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  37.43 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  37.3 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  37.97 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  32.18 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  35.52 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  36.9 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  32.97 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  37.97 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  36.46 
 
 
291 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  34.04 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  37.86 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  36.07 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  39.29 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  36.41 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  34.43 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  37.23 
 
 
280 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  34 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  32.61 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  27.23 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  39.29 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  36.04 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  36.98 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  36.98 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  36.98 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  36.98 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  41.12 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  31.61 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  38.05 
 
 
342 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  37.02 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  37.02 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  31.79 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  35.57 
 
 
262 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  30.34 
 
 
169 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  37.02 
 
 
920 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  28.08 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  33.82 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  36.05 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  30.82 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  30.82 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  30.82 
 
 
170 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  30.82 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  37.5 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  36.88 
 
 
318 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  29.68 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  28.85 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  28.77 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  29.46 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  30.43 
 
 
168 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  30.63 
 
 
170 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  29.03 
 
 
170 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  29.86 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  30.56 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  32.14 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  31.62 
 
 
252 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  27.71 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  28.16 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  32.28 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  31.68 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  27.97 
 
 
253 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  28.98 
 
 
230 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  32.43 
 
 
253 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  33.82 
 
 
257 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>