75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01909 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01909  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  517  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  73.57 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4525  hypothetical protein  51.89 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4128  DNA damage-inducible mutagenesis protein  51.88 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  48.61 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  50.5 
 
 		 238 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  49.5 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  48.8 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  49.28 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  48.33 
 
 		 235 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  48.33 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  47.85 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  47.85 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  47.85 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  46.11 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  40.52 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  49.25 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  45.55 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  46.07 
 
 		 235 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  47.29 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  46 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  48.66 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  43.23 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  40.4 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  41.62 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  44.5 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  41.92 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  47.5 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  47.5 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3166  hypothetical protein  42.59 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  42.41 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  47.96 
 
 		 920 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  41.67 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  48.78 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  45.08 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.92 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  40.59 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  40.59 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  46.62 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  46.62 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2386  hypothetical protein  41.06 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  44.59 
 
 		 205 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  42.45 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  40.45 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  43.41 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  44.32 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  45.27 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  43.14 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  43.37 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  46.67 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  38.94 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  46 
 
 		 206 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  36.97 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  44 
 
 		 206 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  40.89 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  31.63 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  37.2 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  39.79 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  34.59 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  36.09 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  37.28 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  40.1 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  36.59 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  36.2 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  36.2 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  37.3 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  31.71 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  28.19 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.11 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>