96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0179 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  68.82 
 
 		 170 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  66.67 
 
 		 169 aa  225  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  62.5 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  64.12 
 
 		 170 aa  221  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  63.53 
 
 		 170 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  63.53 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  63.53 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  63.53 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  63.37 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  62.94 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  63.37 
 
 		 170 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  62.94 
 
 		 170 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  63.84 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  65 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  63.09 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  44.26 
 
 		 290 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  35.98 
 
 		 214 aa  94.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  35.98 
 
 		 214 aa  94.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.67 
 
 		 278 aa  88.2  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  36.67 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  37.84 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  28.66 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  38.53 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  33.06 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  36.21 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  30.58 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  37.07 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  36.21 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  36.21 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  35.58 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  35.45 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  43.84 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  27.97 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  34.91 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  32.26 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  32.26 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  32.26 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  25.69 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  27.87 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  30.58 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  30.63 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  32.17 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  27.56 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  24.43 
 
 		 250 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  33.98 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  28.7 
 
 		 260 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  31.58 
 
 		 920 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  29.35 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  31.76 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  33.67 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  30.48 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  33.71 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  33.67 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  35.53 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  27.91 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  27.17 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  30.1 
 
 		 251 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  27.27 
 
 		 236 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  27.84 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  31.94 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  30.26 
 
 		 207 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  28.26 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  25.69 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  23.66 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  28.21 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  28.21 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  32.39 
 
 		 244 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  34.95 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  28.12 
 
 		 255 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  28.12 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  27.17 
 
 		 280 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.4 
 
 		 231 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  32.93 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  29.07 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  35.21 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  32.61 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  36.62 
 
 		 253 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  25.74 
 
 		 244 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  28.72 
 
 		 318 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  26.09 
 
 		 273 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>