63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2548 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  100 
 
 		 168 aa  346  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  89.88 
 
 		 168 aa  297  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  65.48 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  60.12 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  58.58 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  58.58 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  57.99 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  59.17 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2685  cell division inhibitor SulA  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00969  hypothetical protein  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000604934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1122  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000048454  normal  0.770648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2358  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2162  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000180135  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2638  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000242491  unclonable  0.000000025128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1072  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000394327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1067  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.84459e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00962  SOS cell division inhibitor  56.55 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000284477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1146  SOS cell division inhibitor  50.6 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0126315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1029  SOS cell division inhibitor  50.6 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000336397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1134  SOS cell division inhibitor  50.6 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0155538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1180  SOS cell division inhibitor  50.6 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1112  SOS cell division inhibitor  50.6 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00640021  hitchhiker  0.00133403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1470  SOS cell division inhibitor  56.12 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000194429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  29.41 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  33.61 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  33.61 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  34.38 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  29.7 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  28.23 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  31.2 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  28.72 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  28.26 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.66 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  29.57 
 
 		 290 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  28.78 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  28.26 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  31.82 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  27.83 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  28.09 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  31.68 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  29.03 
 
 		 278 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  26.09 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  30.34 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  29.71 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  30.69 
 
 		 206 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  31.67 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  30.69 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  31.68 
 
 		 920 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  27.52 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>