113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3998 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  64.84 
 
 
170 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  64.84 
 
 
170 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  64.84 
 
 
170 aa  227  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  64.84 
 
 
170 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  60.44 
 
 
170 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  60.44 
 
 
170 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  63.19 
 
 
170 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  61.54 
 
 
170 aa  222  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  63.19 
 
 
170 aa  222  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  59.89 
 
 
170 aa  221  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  62.86 
 
 
168 aa  217  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  62.5 
 
 
170 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  58.79 
 
 
169 aa  214  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  71.33 
 
 
168 aa  197  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  63.64 
 
 
168 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  44.07 
 
 
290 aa  92.8  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  36.13 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  36.13 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  38.83 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  32.46 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  32.09 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  32.54 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  33.94 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  31.58 
 
 
207 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  28.46 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  33.94 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  29.69 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.73 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  29.69 
 
 
223 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  41.1 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  35 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  35 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  35 
 
 
206 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  27.1 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  27.12 
 
 
240 aa  62.4  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  35 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  26.98 
 
 
235 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  26.63 
 
 
238 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  26.04 
 
 
238 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  28.08 
 
 
207 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  30.12 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  25.16 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  23.02 
 
 
260 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  32.71 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  25.6 
 
 
291 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  29.89 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  29.89 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  29.89 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  35.21 
 
 
244 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  30.53 
 
 
920 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  31.71 
 
 
264 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  23.94 
 
 
251 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  35.62 
 
 
249 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  29.13 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  27.21 
 
 
238 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  28.86 
 
 
238 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  28.42 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  30.85 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  34.29 
 
 
245 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  29.13 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  34 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  32.56 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1030  GGDEF  24.62 
 
 
300 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  33 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  29.55 
 
 
231 aa  47.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  22.81 
 
 
250 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  29.47 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  24.56 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  29.41 
 
 
168 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  28.43 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  21.43 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  29.03 
 
 
251 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  24.62 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  34.52 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  25.95 
 
 
255 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  33.67 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  27.17 
 
 
280 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  27.78 
 
 
230 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  25.71 
 
 
230 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  27.93 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  32.63 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  27.06 
 
 
136 aa  44.7  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  30.59 
 
 
262 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  25.23 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  29.93 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  20.63 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>