37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3873 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  100 
 
 		 157 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  79.62 
 
 		 156 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  77.07 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  72.44 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  72.44 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  71.79 
 
 		 158 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  73.29 
 
 		 158 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  66.46 
 
 		 161 aa  193  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  64.85 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  65.82 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  59.24 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  33.66 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  36.63 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  30.56 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  35.64 
 
 		 290 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  33.67 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  30.95 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  30.95 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  31.63 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  33.72 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  29.89 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  29.89 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  29.89 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.74 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.74 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  32.61 
 
 		 168 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  30.38 
 
 		 234 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  34.41 
 
 		 278 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  30.23 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>