36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2235 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  27.17 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  28 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  28.75 
 
 
158 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  26.37 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  27.38 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  26.97 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  26.97 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  30.56 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  25.56 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  25 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  31.71 
 
 
272 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  26.25 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  27.06 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  26.67 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  25.58 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  27.06 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  29.41 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  26.19 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  25 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  30.77 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  25.88 
 
 
168 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  29.41 
 
 
164 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  26.51 
 
 
168 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  31.25 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  26.83 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  26.83 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  26.83 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  26.83 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>