36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3284 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  100 
 
 
156 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  91.03 
 
 
156 aa  278  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  79.62 
 
 
157 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  71.23 
 
 
158 aa  196  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  69.87 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  69.23 
 
 
158 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  68.59 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  65.61 
 
 
161 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  65.22 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  63.29 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  58.33 
 
 
156 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  34.65 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  37 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  36.63 
 
 
290 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  47.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  35.23 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  29.51 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.74 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  28.47 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.74 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  32.63 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  31.63 
 
 
170 aa  43.9  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  30.59 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  30.59 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  30.43 
 
 
234 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  32.63 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  32.97 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  30.59 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  37.84 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  34.18 
 
 
168 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>