36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2142 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  98.1 
 
 
158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  93.67 
 
 
158 aa  286  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  89.73 
 
 
158 aa  253  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  71.79 
 
 
157 aa  214  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  69.23 
 
 
156 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  66.67 
 
 
156 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  63.12 
 
 
161 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  66.67 
 
 
156 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  61.59 
 
 
165 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  60.69 
 
 
156 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  36.36 
 
 
165 aa  57.4  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  35.35 
 
 
290 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  33.66 
 
 
139 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  36.56 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  36.56 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  29.07 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  30.59 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 
168 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  32.26 
 
 
278 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  32.99 
 
 
168 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  28.42 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  28.42 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  29.47 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  31.33 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  32.91 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>