43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1586 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  65.82 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  67.81 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  66.67 
 
 		 158 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  64.78 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  63.29 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  66.67 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  64.67 
 
 		 158 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  58.39 
 
 		 161 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  57.58 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  61.15 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  30.28 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  38.24 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  37.89 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  38.95 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  38.95 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  28 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 290 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  31.87 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  30.77 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  30.77 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  30.77 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  37.96 
 
 		 262 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  35.79 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  28.41 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  31.63 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  30.39 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  29.89 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  30.49 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  30.49 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  30.49 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  29.89 
 
 		 168 aa  43.9  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  32.17 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  29.81 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  29.11 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>