72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3807 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  490  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  70.04 
 
 
253 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  69.64 
 
 
253 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  69.14 
 
 
254 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  62.14 
 
 
253 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  62.71 
 
 
252 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  68.02 
 
 
247 aa  294  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  64.26 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  60.68 
 
 
250 aa  258  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  52.3 
 
 
243 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  51.02 
 
 
249 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  50.43 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  48.02 
 
 
253 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  48.02 
 
 
253 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  49.39 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  41.48 
 
 
265 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  34.2 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  66.3 
 
 
122 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  37.9 
 
 
259 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  29.24 
 
 
244 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  35.04 
 
 
275 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  31.98 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  34.58 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  35.22 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  36.86 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  36.17 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.57 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  35.23 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  35.78 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  31.84 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  34.75 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  32.27 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.57 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  32.92 
 
 
278 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  33.21 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  29.73 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  31.44 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  31.82 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  31.68 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  41.41 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  30.88 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  31.48 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  30.86 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  30.56 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  27.73 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  27.84 
 
 
170 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  30.59 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  25.19 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  30.59 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  32.03 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  29.41 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  29.7 
 
 
294 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  38.38 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  28.3 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  34.26 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  29.71 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  27.55 
 
 
168 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  29.07 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  27.91 
 
 
169 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  29.58 
 
 
168 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  29.07 
 
 
168 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  31.97 
 
 
207 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>