79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5155 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  84.43 
 
 		 249 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  59.05 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  59.05 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  60.73 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  55.08 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  52.87 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  53.75 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  51.23 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  50.22 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  47.66 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  51.02 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  50.42 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  48.51 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  41.15 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  41.56 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  33.8 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.92 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  40.69 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  30.96 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  34.01 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  29.85 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  34.69 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  47.67 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  38.98 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  34.58 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  35.61 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  42.11 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  35.44 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  37.89 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.32 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  34.21 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  35.21 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  36.81 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  35.57 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  30.16 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  33.09 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  30.93 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  30.86 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.14 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  34.62 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  31.2 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  31.65 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  31.25 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  34.42 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  28.19 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  28.89 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  34.46 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.07 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  32.94 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.07 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  31.88 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  32.56 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  27.21 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  27.51 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  30.92 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  33.53 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  36.26 
 
 		 206 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  32.88 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  34.31 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  32.56 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  28.26 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  35.06 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  32.56 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  30.5 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  33.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  31.4 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  27.59 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  31.22 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  37.24 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  32.94 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  29.61 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  30.49 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>