50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3265 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  631  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  42.9 
 
 
314 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  41.72 
 
 
314 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  39.16 
 
 
318 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  35.38 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  38.21 
 
 
275 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  34.88 
 
 
287 aa  99.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  43.95 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  34.72 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  36.99 
 
 
272 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  32.13 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  31.6 
 
 
270 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  32.71 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  35.35 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  31.28 
 
 
261 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  29.22 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  30.81 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  31.6 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  33.8 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  26.73 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  33.63 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  31.11 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  40.5 
 
 
249 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  28.25 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  32.64 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  36.02 
 
 
217 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  38.79 
 
 
249 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  25.9 
 
 
253 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  36.43 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  30.09 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  30.09 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  30.09 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  31.8 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  34.08 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  31.76 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  33.14 
 
 
278 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  29.56 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  31.08 
 
 
259 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  32.56 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  33.57 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  33.54 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  32.92 
 
 
236 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  39 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  32.8 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  39 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  39 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  28.66 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  33 
 
 
240 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  36.25 
 
 
235 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>