58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5203 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  64.68 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  62.7 
 
 
253 aa  291  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  64.26 
 
 
251 aa  278  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  60.26 
 
 
252 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  65.29 
 
 
247 aa  275  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  62.18 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  60.17 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  57.27 
 
 
250 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  55.93 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  53.69 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  53.69 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  54.46 
 
 
260 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  55.08 
 
 
249 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  53.69 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  37.95 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  45.66 
 
 
265 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  40.49 
 
 
259 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  37.56 
 
 
275 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  34.15 
 
 
245 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  51 
 
 
122 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  36.87 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  32.5 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  37.09 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  37.67 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  36.81 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  34.09 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  37.31 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  38.77 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  33.71 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  36.22 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  38.52 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  31.71 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  34.08 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  33.96 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  35.07 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  32.39 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  40.94 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  32.86 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  28.63 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  34.01 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  30.82 
 
 
272 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.31 
 
 
231 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  33.83 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  27.86 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  30.72 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  28.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  30.88 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  29.68 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  28.57 
 
 
228 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  27.7 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  29.86 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3206  hypothetical protein  31.11 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0144192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  27.88 
 
 
229 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  31.95 
 
 
235 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  32.59 
 
 
236 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>