54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3767 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  69.1 
 
 		 253 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  66.12 
 
 		 253 aa  321  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  64.9 
 
 		 253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  71.55 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  68.02 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  63.87 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  65.29 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  66.08 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  50.22 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  53.75 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  50.45 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  51.16 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  51.16 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  49.58 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  40.85 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  35.65 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  64.29 
 
 		 122 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  32.09 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  32.19 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  32.86 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  33.07 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  30.81 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  31.94 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  32.81 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  34.94 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  32.97 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  33.08 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.37 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  30.22 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  31.88 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  35.16 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  38.85 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  32.91 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  32.77 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  31.58 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  27.44 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  30.53 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  30.71 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  29.83 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  29.2 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1382  hypothetical protein  27 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.884364  hitchhiker  0.00791695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  28.28 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  30.22 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  27.59 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  27.46 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  28.72 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  31.68 
 
 		 214 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  31.68 
 
 		 214 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>