48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4463 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  38.94 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  39.53 
 
 
253 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  39.53 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  40.89 
 
 
257 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  39.04 
 
 
253 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  39.04 
 
 
253 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  37.67 
 
 
243 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  38.79 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  37.16 
 
 
252 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  38.31 
 
 
251 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  36.73 
 
 
250 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  41.28 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  39.42 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  38.4 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  36 
 
 
244 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  36 
 
 
247 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  35.62 
 
 
245 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  32.2 
 
 
244 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  34.23 
 
 
253 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  34.14 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  39.74 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  34.05 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  35.22 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  34.87 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  32.49 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  37.64 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  36.48 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  33.88 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  34.16 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  34.87 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  35.24 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  35.62 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  34.25 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  32.82 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  35.43 
 
 
195 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.43 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  29.81 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  31.16 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  36.51 
 
 
169 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>