73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2296 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  73.55 
 
 		 252 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  70.73 
 
 		 253 aa  337  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  60 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  59.57 
 
 		 253 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  63.6 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  62.55 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  60.68 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  56.65 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  48.92 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  48.51 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  45.75 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  45.83 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  45.83 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  46.82 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  39.27 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  39.26 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  63.04 
 
 		 122 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  34.72 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  34.86 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  33.02 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  34.58 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  32.93 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  32.05 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  34.01 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  32.93 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  31.05 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  33.82 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  31.85 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  30.5 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  31.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  29.07 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  35.74 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  30.29 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  32.51 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  38.46 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  31.76 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  28.65 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  32.12 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2338  hypothetical protein  40.87 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2250  hypothetical protein  41.44 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1965  hypothetical protein  33.54 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  32.09 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1610  hypothetical protein  40.54 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1765  hypothetical protein  32.28 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2080  hypothetical protein  30.63 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  31.73 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0424  hypothetical protein  30.63 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0442228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  29.37 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  30.08 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  29.35 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  34.56 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  30.43 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  25.43 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  32.63 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  30.84 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  33.13 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  31.82 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  30.12 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  32.97 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  32.58 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  26.87 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  31.97 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2670  hypothetical protein  34.23 
 
 		 286 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.815941  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  28.69 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  28.69 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  32.31 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  29.93 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2202  hypothetical protein  34.46 
 
 		 246 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0843846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>