More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1120 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1120  recA protein  100 
 
 		 348 aa  698    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2973  recA protein  76.49 
 
 		 375 aa  528  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.480691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.58 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  62.73 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  61.35 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  61.25 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  60.31 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  61.61 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  60.12 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  58.66 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  61.89 
 
 		 336 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  60.06 
 
 		 364 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  60.68 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  60.06 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  60.62 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  59.58 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  59.58 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  61.35 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  61.18 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  61.56 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  59.33 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  59.2 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  59.57 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  59.2 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  59.7 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  60.88 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  59.63 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  59.01 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  59.44 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  60.06 
 
 		 346 aa  401  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  58.9 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  57.7 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  60 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  60.25 
 
 		 350 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  59.51 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  60 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  60.62 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  60 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  57.51 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  59.33 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  60.3 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  57.06 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  58.41 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  60 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  60.31 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  61.49 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  56.93 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  61.56 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  59.63 
 
 		 347 aa  401  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  61.25 
 
 		 364 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  58.9 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  57.45 
 
 		 347 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  62.18 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  58.18 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  58.18 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  58.28 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  59.57 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  57.69 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  59.69 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  59.2 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  58.91 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  61.51 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  58.91 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  58.88 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  58.66 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  55.79 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  60.48 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  59.51 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  58.91 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  60.98 
 
 		 349 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  57.98 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  58.98 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  58.59 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  57.14 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  60.31 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  57.89 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  57.98 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  56.8 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  61.52 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  59.2 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  58.51 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  57.8 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  58.01 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  57.06 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  57.67 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  61.96 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  59.88 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  57.98 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  59.69 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  59.34 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  58.97 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  57.06 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  60.12 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  58.98 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  58.97 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  56.4 
 
 		 390 aa  394  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  59.69 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  59.94 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  57.19 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  56.84 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>