More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2081 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2081  RecA domain protein  100 
 
 		 132 aa  264  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  86.78 
 
 		 343 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  87.6 
 
 		 208 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  87.6 
 
 		 208 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  87.6 
 
 		 343 aa  222  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  87.6 
 
 		 343 aa  222  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  86.78 
 
 		 208 aa  222  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  86.78 
 
 		 208 aa  222  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  86.78 
 
 		 343 aa  221  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  85.12 
 
 		 343 aa  220  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  84.3 
 
 		 343 aa  219  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  80.83 
 
 		 355 aa  204  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  72.73 
 
 		 364 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  76.86 
 
 		 379 aa  193  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  76.03 
 
 		 379 aa  193  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  75.21 
 
 		 346 aa  192  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  74.38 
 
 		 364 aa  190  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  73.17 
 
 		 343 aa  190  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  72.36 
 
 		 364 aa  189  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  72.5 
 
 		 347 aa  188  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  71.77 
 
 		 347 aa  188  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  70.97 
 
 		 362 aa  188  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  71.77 
 
 		 347 aa  188  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  72.13 
 
 		 357 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  76.86 
 
 		 387 aa  187  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  71.67 
 
 		 365 aa  186  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  71.77 
 
 		 376 aa  186  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  69.11 
 
 		 347 aa  186  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  70.73 
 
 		 390 aa  185  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  70 
 
 		 351 aa  185  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  73.55 
 
 		 345 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  69.92 
 
 		 345 aa  185  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  71.67 
 
 		 341 aa  185  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  68.29 
 
 		 347 aa  184  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  69.11 
 
 		 344 aa  184  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  71.67 
 
 		 350 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  70.97 
 
 		 362 aa  184  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  72.5 
 
 		 360 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  70.25 
 
 		 366 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  70.83 
 
 		 349 aa  184  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  69.92 
 
 		 349 aa  183  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  70.83 
 
 		 350 aa  183  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  70.83 
 
 		 351 aa  182  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  69.35 
 
 		 347 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  70.83 
 
 		 376 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  71.9 
 
 		 729 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  71.67 
 
 		 378 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  69.11 
 
 		 347 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  71.67 
 
 		 350 aa  181  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  69.35 
 
 		 348 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  69.35 
 
 		 348 aa  181  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  70.97 
 
 		 362 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  72.5 
 
 		 359 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  71.31 
 
 		 356 aa  181  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  69.11 
 
 		 348 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  71.07 
 
 		 357 aa  181  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1188  RecA domain protein  90.62 
 
 		 101 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000363336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  67.48 
 
 		 344 aa  181  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  68.29 
 
 		 349 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0425  recA protein  70.73 
 
 		 348 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  69.11 
 
 		 366 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  72.13 
 
 		 346 aa  181  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  69.35 
 
 		 366 aa  181  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  69.11 
 
 		 366 aa  181  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  70 
 
 		 352 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  70 
 
 		 350 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  68.6 
 
 		 347 aa  180  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  67.21 
 
 		 383 aa  180  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  67.48 
 
 		 352 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  67.48 
 
 		 352 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  70.83 
 
 		 345 aa  180  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  69.11 
 
 		 345 aa  180  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  70 
 
 		 347 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  70 
 
 		 347 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  70 
 
 		 347 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  70.4 
 
 		 347 aa  179  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  68.55 
 
 		 343 aa  179  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  69.35 
 
 		 363 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  70.25 
 
 		 368 aa  179  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  68 
 
 		 363 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  67.74 
 
 		 363 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  69.75 
 
 		 379 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  68.33 
 
 		 790 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  70 
 
 		 346 aa  179  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  68.03 
 
 		 356 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  68.6 
 
 		 357 aa  179  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  68.33 
 
 		 385 aa  179  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  67.2 
 
 		 363 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  70 
 
 		 347 aa  178  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  66.94 
 
 		 343 aa  178  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  65.83 
 
 		 346 aa  178  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  68.8 
 
 		 366 aa  178  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  70.16 
 
 		 364 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  70.16 
 
 		 363 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0354  RecA protein  67.48 
 
 		 349 aa  178  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.922362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  68.55 
 
 		 363 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  68.29 
 
 		 347 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  69.42 
 
 		 361 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.85 
 
 		 418 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  69.17 
 
 		 345 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>