More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0354 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0354  RecA protein  100 
 
 		 349 aa  708    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.922362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  75.93 
 
 		 348 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  72.14 
 
 		 348 aa  518  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  75.6 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  71.85 
 
 		 348 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  70.91 
 
 		 345 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  75.72 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  76.29 
 
 		 347 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  71.98 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  71.98 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  70 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  70.93 
 
 		 348 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  69.05 
 
 		 349 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  72.48 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  72.78 
 
 		 354 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  72.78 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  72.48 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  70.61 
 
 		 345 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  72.48 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  71.77 
 
 		 347 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  77.51 
 
 		 347 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  70.61 
 
 		 345 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  72.48 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  73.84 
 
 		 344 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  68.88 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  71.34 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  70.36 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  72.67 
 
 		 344 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  71.78 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  68.5 
 
 		 355 aa  497  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  69.54 
 
 		 349 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  71.78 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  70.95 
 
 		 347 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  69.09 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  69.57 
 
 		 352 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  75.08 
 
 		 347 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  66.38 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  73.72 
 
 		 345 aa  491  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  74.46 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  67.25 
 
 		 354 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  71.65 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  73.72 
 
 		 354 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  69.7 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  68.97 
 
 		 352 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  68.15 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  71.65 
 
 		 362 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  69.97 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  70.5 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3259  recombinase A  72.57 
 
 		 343 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  69.66 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  70.5 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  69.82 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  71.02 
 
 		 365 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  69.35 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  70.4 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  70.95 
 
 		 345 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  70.72 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  70.4 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  69.78 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.72 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  65.1 
 
 		 357 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.96 
 
 		 362 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  69.57 
 
 		 356 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  69.69 
 
 		 360 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  68.22 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  66.08 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  65.98 
 
 		 353 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  67.56 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  68.94 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  68.81 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0019  recombinase A  72.78 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  68.75 
 
 		 356 aa  474  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  65.41 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  68.73 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  68.56 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  68.94 
 
 		 363 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  69.25 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  68.63 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  71.56 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  69.05 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  68.73 
 
 		 357 aa  474  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  65.78 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  64.43 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  64.43 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  68.73 
 
 		 356 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.83 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  70.64 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  63.79 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  71.83 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  64.93 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  69.1 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>