More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_17531 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  99.73 
 
 		 365 aa  738    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  86.93 
 
 		 377 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  88.86 
 
 		 377 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  99.45 
 
 		 365 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  89.57 
 
 		 367 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  92.7 
 
 		 370 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  100 
 
 		 365 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  88.59 
 
 		 379 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  84.29 
 
 		 376 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  87.28 
 
 		 374 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  80 
 
 		 356 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  75.67 
 
 		 360 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  77.04 
 
 		 349 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  77.04 
 
 		 349 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  77.68 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  76.32 
 
 		 359 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  76.25 
 
 		 358 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  75.96 
 
 		 357 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  62.39 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  63.02 
 
 		 345 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  59.77 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  63.83 
 
 		 359 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  63.17 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  62.84 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  60.83 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.78 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  64.62 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  60.17 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  60.83 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  61.22 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  60.83 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  61.01 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  60.9 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  60.9 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  61.19 
 
 		 346 aa  431  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  65.57 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  62.13 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  63.08 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  63.47 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  63.27 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  62.58 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  62.85 
 
 		 345 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  61 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  63.98 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  63.27 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  63.27 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  62.12 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  65.53 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  63.98 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  59.43 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  63.35 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  64.29 
 
 		 354 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  63.66 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.08 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.08 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  61.43 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  59.3 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  63.35 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  61.73 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  61.61 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.75 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  61.38 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  62.93 
 
 		 343 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  63.35 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  60.67 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  62.88 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  62.09 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  63.16 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  61.61 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  61.93 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  61.59 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  62.73 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  63.01 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  62.05 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  61.31 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  58.33 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.35 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  63.16 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  63.35 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  62.46 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  63.04 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  63.04 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  63.04 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  58.75 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  60.98 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  60.95 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  61.54 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  57.51 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  63.35 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  63.66 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  59.72 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0425  recA protein  63.66 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  63.5 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  60 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  62.69 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  59.72 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  63.27 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  59.72 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  61.49 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  60.4 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>