More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0348 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  100 
 
 		 356 aa  720    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  84.68 
 
 		 374 aa  591  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  81.58 
 
 		 377 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  81.58 
 
 		 377 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  81.27 
 
 		 379 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  81.79 
 
 		 376 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  81.98 
 
 		 367 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  80 
 
 		 365 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  85.07 
 
 		 358 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  82.93 
 
 		 349 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  79.65 
 
 		 365 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  79.65 
 
 		 365 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  82.93 
 
 		 349 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  81.57 
 
 		 370 aa  564  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  83.02 
 
 		 356 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  79.65 
 
 		 357 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  83.43 
 
 		 359 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  76.38 
 
 		 360 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  64.71 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  66.57 
 
 		 359 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  65.09 
 
 		 345 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  64.71 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  64.56 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  64.71 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  64.43 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.2 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  64.12 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  64.46 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  64.12 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  64.12 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.13 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  64.65 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  67.18 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  62.76 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  64.78 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  63.86 
 
 		 350 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  62.87 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  64.13 
 
 		 364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  64.72 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  63.77 
 
 		 349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.53 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  64.37 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  63.86 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  59.77 
 
 		 351 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  65.54 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  61.03 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  64.22 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  64.22 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  64.65 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  61.76 
 
 		 350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  63.36 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  64.74 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  65.94 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  64.74 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.96 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  63.08 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.02 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  66.77 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  63.8 
 
 		 347 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  65.22 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  62.77 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  64.51 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  61.77 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.94 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  64.14 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  60.81 
 
 		 351 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  61.45 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  64.71 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  62.77 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  65.53 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  67.39 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  64.44 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  64.6 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.36 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  65.22 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.94 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  62.39 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.36 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  62.69 
 
 		 363 aa  434  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  65.53 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.34 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  66.15 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  60.92 
 
 		 346 aa  434  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  65.53 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  60.92 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  64.6 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64.69 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  65.22 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  64.94 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  63.8 
 
 		 343 aa  434  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  65.53 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  61.63 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  62.92 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  65.34 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  62.97 
 
 		 352 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  60.98 
 
 		 352 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  60.86 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  62.92 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  61.34 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  63.66 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>