More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2695 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  100 
 
 		 360 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  78.84 
 
 		 358 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  78.59 
 
 		 356 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  75.5 
 
 		 349 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  75.5 
 
 		 349 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  75.67 
 
 		 365 aa  547  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  73.52 
 
 		 376 aa  544  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  75.15 
 
 		 367 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  75.68 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  75.68 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  77.48 
 
 		 374 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  79.17 
 
 		 357 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  78.9 
 
 		 359 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  74.85 
 
 		 370 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  75.98 
 
 		 379 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  75.99 
 
 		 365 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  75.99 
 
 		 365 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  76.38 
 
 		 356 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  62.31 
 
 		 345 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  61.19 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  61.52 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  62.06 
 
 		 356 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  60.83 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  63.35 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  59.37 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  61.66 
 
 		 376 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  64.31 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  61.18 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  65.24 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  60.77 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  63.61 
 
 		 424 aa  434  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  60.77 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  60.77 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  61.36 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  62.24 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  63.61 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  59.71 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  60.06 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  61.4 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  63.08 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  61.38 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  61.45 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  63.08 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.27 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  60.48 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  60.47 
 
 		 345 aa  431  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  61.7 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.54 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  62.61 
 
 		 352 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  61.54 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  61.42 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  61.44 
 
 		 364 aa  427  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  60.86 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  61.54 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  60.96 
 
 		 368 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  63.19 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  61.61 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  63.66 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  61.92 
 
 		 378 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  62.76 
 
 		 349 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  60.74 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  60.61 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  60.61 
 
 		 335 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  62.69 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  59.82 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  63.16 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  61.66 
 
 		 349 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  61.04 
 
 		 354 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  61.54 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  61.85 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.18 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  58.43 
 
 		 414 aa  424  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  63.35 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  63.35 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  59.94 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  60 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  60.61 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  62.15 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  61.24 
 
 		 363 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  61.33 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.24 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  62.73 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  60.06 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  61.11 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  62.42 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  61.89 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  60.61 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  61.59 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  61.59 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  60.4 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  59.08 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  60.89 
 
 		 366 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  61.18 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  60.96 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  58.92 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  62.8 
 
 		 344 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  62.42 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.69 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  62.11 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>