203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0155 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  44.22 
 
 		 208 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  42.06 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  41.15 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  40 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  32.58 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  39.31 
 
 		 185 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  32.55 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  33.89 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  32.82 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  31.22 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  32.82 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  29.31 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  36.91 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  31.8 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  30.77 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  37.58 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  31.96 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  31.02 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.96 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  32.02 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  33.5 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  37.93 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  40.8 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  30.43 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  40.8 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  29.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  32.68 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  29.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  29.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  32.43 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  32.43 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  29.07 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  39.09 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  33.11 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  39.34 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  34.29 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  32.24 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  38.76 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  31.08 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  38.52 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  37.1 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  31.76 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  30.54 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  31.67 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  30.86 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  37.21 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  36.8 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  36.8 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  36.8 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  30.86 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  32.12 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  36.8 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  36.8 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  31.82 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  31.76 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  28.93 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  29.49 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  31.54 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  26.92 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  33.64 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  28.12 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  30 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  27.4 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  28.96 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  28.36 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  30.88 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  29.51 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  34.55 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  27.14 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  27.53 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  33.33 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  27.52 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  33 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  27.8 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  26.51 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  26.18 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  25.61 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  29.68 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  27.4 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.22 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  26.2 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  31.08 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  33.33 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  27.27 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  26.53 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  31.08 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  33.33 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  28.19 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  27.78 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  26.27 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  27.91 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  29.84 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  34 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>