247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2000 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  93.33 
 
 		 210 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  78.57 
 
 		 210 aa  348  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  77.14 
 
 		 210 aa  341  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  68.25 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  70.56 
 
 		 223 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  68.25 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  68.25 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  68.72 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  63.68 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  63.68 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  63.68 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  63.68 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  63.68 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  63.68 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  62.74 
 
 		 212 aa  276  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  62.74 
 
 		 212 aa  276  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  62.74 
 
 		 212 aa  275  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  64.39 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  64.53 
 
 		 215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  61.11 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  63.55 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  63.55 
 
 		 215 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  63.55 
 
 		 215 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  61.5 
 
 		 213 aa  264  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  60.38 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  60.38 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  60.38 
 
 		 212 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  60.38 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  60.38 
 
 		 212 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  60.59 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  59.33 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  60.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  57.75 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  59.11 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  59.11 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  54.93 
 
 		 215 aa  240  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  54.42 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  57.48 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  53.27 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  53 
 
 		 217 aa  227  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  54.76 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  49.11 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  50.24 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  45.95 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  49.07 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  46.34 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  43.64 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  43.64 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  44.39 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  46.57 
 
 		 227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  45.05 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  43.48 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  45.54 
 
 		 227 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  42.25 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  44.06 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  41.6 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  44.5 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  36.24 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  39.44 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  36.24 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  41.9 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  40.2 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  39.34 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  37.98 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  38.12 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  38.79 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  38.92 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  38.92 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  37.3 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  38.66 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  40.11 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  34.7 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  34.52 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  39.35 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  32.37 
 
 		 230 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  35.16 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  35.94 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.76 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  36.23 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  32.2 
 
 		 223 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  33.94 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  35.61 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  39.35 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  35.61 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  35.61 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  39.35 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  32.69 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  36.02 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  34.15 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  34.18 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  35.29 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  33.01 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  33.01 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>