206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3010 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  44.22 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  46.84 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  40.83 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  35.08 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  44.24 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  34.01 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  31.77 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  30.48 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  37.95 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  37.95 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  34.03 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  36.14 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  35.6 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  33.7 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  33.33 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  35.15 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.72 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  31.98 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  33.93 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  33.85 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  31.89 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  31.89 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  32.47 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  29.59 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  28.57 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  32.56 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  33.53 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  31.77 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  31.21 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  31.52 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.81 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  30.64 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  36.59 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.81 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  28.21 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  32.6 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  30.15 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  29.76 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  32.5 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  31.03 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  35 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  30.24 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  31.14 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  31.21 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  28.05 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  29.3 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  29.69 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  28.05 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  32.12 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  31.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  28.83 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  28.05 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  31.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  29.72 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  35.77 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  30.05 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  35.77 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  30.05 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  30.88 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  30.05 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  31.37 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  34.31 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  29.53 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.54 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  29.3 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  28.77 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  28.57 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  31.33 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  32.2 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  33.61 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  30.05 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  23.57 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.03 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.03 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  33.61 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  28.5 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  26.96 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  30.13 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  30.46 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  30.81 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  26.18 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  37.29 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  30.54 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  29.94 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  29.38 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  26.37 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  35.19 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>