212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2480 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  41.15 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  38.02 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  35.35 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  31.91 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  34.01 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  34.57 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  30.48 
 
 		 246 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  28.32 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  32.99 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  34.01 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  33.51 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  31.46 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  31.33 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  29.63 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  30.37 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  33.16 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  32.69 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  27.51 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  32.32 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  30.48 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  29.36 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  31.02 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  31.25 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  29.84 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  29.84 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  30.63 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  29.17 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  30.63 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  30.63 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  30.63 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  30.63 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  30.63 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  30.63 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  30.77 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  30.94 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  30.94 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  27.51 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  27.91 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  30.38 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  27.27 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  27.8 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  27.78 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  27.8 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  27.8 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  26.79 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  26.16 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  28.44 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  27.5 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  24.2 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  32.04 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  29.12 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  28.25 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  27.8 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  27.8 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  26.37 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  25.51 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  26.15 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  27.27 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  24.89 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  24.3 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  25.13 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  27.81 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  27.43 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  27.54 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  26.95 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  26.29 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  26.29 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  26.95 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  26.95 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  26.95 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  26.95 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  28 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  26.16 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  29.57 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  26.25 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  29.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  28.66 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  26.86 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  28.96 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  26.13 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  28.33 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  23.84 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  23.84 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  27.62 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  24.5 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  24.73 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  25 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  28.26 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  24.55 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  25.78 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  25.13 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  24.61 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  26.55 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>